Cuenta una antigua leyenda que hace mucho tiempo, existió un zorro diabólico, color de fuego, con 9 colas, cada una como brasas hirvientes y que era capaz de destruir montañas o desencadenar olas gigantes con su poder.
La vida de los habitantes de las aldeas ninja, especialmente la de la aldea de la hoja (Konoha) estaban en juego, así que un valiente ninja enfrentó a dicho demonio y consiguió dominarlo. Se trataba del líder de su aldea, del cuarto Hokage. Y así, muchos eventos trágicos ocurrieron antes y después de esta hazaña, pero gracias a ese legendario ninja, Konoha fue salvada y sus habitantes pudieron seguir viviendo.
Hoy, años después de eso, la aldea vive, resplandece. Protegida por unas enormes montañas, cada una tallada con el rostro de los cuatro hokages que se han sacrificado por ella, la vida se desenvuelve normalmente. Hay comercio, hay guerreros, hay recreaciones varias, y existe, sobre todo, un joven aprendiz ninja travieso y peculiar, llamado Naruto Uzumaki.
Naruto no tiene control, crea caos y desobedece por todas partes. Hoy ha elegido pintar en los rostros esculpidos en la montaña de los hokages, faltando al respeto de sus fundadores. Eso no importa, a los pocos minutos su maestro ninja lo reprende y lo amarra, después lo presenta frente a toda su clase. El castigo es público, pero a Naruto no le interesa la posible humillación sufrida y más bien debe pasar las pruebas escolares. La primera es una técnica (jutsu) de transformación. Aquí Naruto ingenia un jutsu extravagante, el "Sexy no Jutsu", con el que cambia toda su apariencia por el de una chica de buen mirar, desnuda de paso.
Las clases terminan y Naruto y su maestro se retiran a comer un poco de ramen, y platican sobre el futuro del niño. Los héroes del pasado hicieron grandes cosas, salvaron muchas vidas, hay que respetarlos. Pero Naruto no está de acuerdo, los héroes del pasado son superables, Naruto desea ser mejor que todos ellos, quiere ser fuerte, quiere respeto, pero no lo conseguirá si no se gradúa de la escuela ninja. Y la última prueba, el examen final, es un jutsu muy complicado, el "Bushin no Jutsu", la técnica de los clones. Naruto debe ser capaz de crear un clon funcional de el mismo, un clon capaz de pelear, pero nunca ha podido hacerlo bien.. y esta ocasión no es la excepción. Naruto fracasa en su prueba.
Terminados los exámenes, los maestros de Naruto, Iruka y Misuki, platican con Naruto, trantan de reconfortarlo, hacerlo entender la situación. Pero Naruto, que nunca abandona sus gafas, vuelve a colocarlas en su rostro y se aleja del sitio. Uno de sus maestros, Misuki, lo sigue y lo tranquiliza con algunas palabras, después le recomienda hurtar unos pergaminos para estudiar y mejorar sus técnicas. Naruto accede a robar y consigue dichos pergaminos, especialmente uno con técnicas prohibidas.
La aldea completa se entera al poco tiempo de lo ocurrido y persiguen a Naruto. de hecho todos tienen sentimientos negativos hacia él, lo ven como a un asesino, una paria. Este es un buen pretexto para desahogar su odio y justificar muchas cosas. Iruka, su sensei, recuerda entonces que de niño pudo ver al zorro de 9 colas (kyuubi) y ahí aprendió de ese horrible ser lo que era estar sólo en el mundo, perder a la gente importante. La empatía con Naruto es obvia.
Naruto parece estar muy sólo y busca reconocimiento para acercarse a las personas, dejar de vivir en las sombras. Así que Iruka, en lugar de unirse a la gente que desea castigos para el travieso ninja, se va calmadamente a buscarlo y platica con él. Pero en ese momento Misuki, el otro "sensei", aparece y los ataca por sorpresa. Después de desvelar que ha engañado a Naruto para conseguir esos pergaminos y venderlos a otras aldeas, dispara un secreto que Naruto no debía escuchar: "En esta aldea existe una regla, y esa es que nadie puede decirte que.. TÚ eres el kyuubi que atacó a la aldea hace 12 años. Y eres tú quien mató a los padres de Izuka y destruyó la aldea".
Naruto queda paralizado. Nadie se acerca a él, nadie intenta entenderlo, porque él representa el dolor y las muertes de muchos nobles ninjas. Pero Mizuki no tiene suficiente con herir psicológicamente a Naruto, también lo ataca con armas ninja intentando asesinarlo, sin embargo, Iruka se interpone en el camino de esas armas y recibe todo el daño. Su estomago es herido por una kunai, su espalda por una shuriken, y la sangre brota de su boca, pero aún con energía, pide a Naruto que despierte, porque él no le recrimina nada por la muerte de sus padres. Incluso entiende su soledad.. y lo entiende como a uno de sus mejores alumnos.
Naruto observa a su debilitado sensei pelear contra Mizuki, en un pelea que claramente tiene perdida, hasta que rompe en desesperación y decide actuar. Utilizando el conocimiento adquirido en el pergamino robado, perfecciona y hace suya la técnica que no podía dominar. "Kage bunshin no Jutsu". Y cientos de clones aparecen y derrotan a Mizuki. Naruto abandona su soledad, sus gafas, y recibe de Iruka una bandana con el símbolo de Konoha. Así es, finalmente se ha graduado de la escuela ninja.
